بررسی تاثیر تعداد سطوح یک صفت آستانه‌ای بر دقت برآورد ارزش های ارثی، روندهای ژنتیکی، فنوتیپی و همخونی یک جمعیت اصلاحی

Authors

  • اسلمی نژاد, علی اصغر
  • خجسته کی, مهدی
  • عباسی, مختارعلی
  • نوبری, کریم
Abstract:

To investigate the effects of categorical trait levels on EBVs accuracies, genetic and phenotypic trends and inbreeding coefficient, a breeding stock contained 400 animals was simulated through stochastic method using R programming package. The population was simulated for 7 generations while each generation contained 200 animals. The generations were overlapped and in each ones 20 percent of the best males and all of the females had a chance to participate in the mating program up to 5 generations. A categorical trait with heritability of 0.25, mean of 5 and standard deviation of 2 was simulated, and on the basis of recording approach, 4 scenarios were designed. In the first scenario a threshold trait was measured as continuous records, while for scenarios 2 to 4, regarding to the appraiser ability a threshold trait were recorded in 3, 5 and 9 categories respectively. Breeding values were estimated by a simple, single trait animal model and all scenarios were replicated for 10 times. The accuracy of breeding value estimations for scenarios 1 to 4 were 0.62, 0.49, 0.59 and 0.61 respectively (p<0.01). Through 7 generations, the genetic trends for scenarios 1 to 4 were 0.212, 0.162, 0.195 and 0.205 and the phenotypic trends were 0.185, 0.137, 0.163 and 0.179 respectively (p<0.01) .The mean of inbreeding coefficient for scenarios 1 to 4 were estimated 0.0053, 0.0052, 0.0052 and 0.0050 respectively (p>0.05). Results showed that, the improvement of recording accuracies for threshold traits lead to increasing in the accuracy of breeding value estimations and the genetic gain. So this is concluded that the development of more accurate measurement tools for threshold traits, could improve the genetic gain and breeding program efficiency.                                                                                     

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

پیش بینی ارزش ارثی و برآورد پارامترها و روندهای ژنتیکی و فنوتیپی صفات رشد گوسفندان زندی

برای برآورد مولفه¬های واریانس-کوواریانس و پارامتر¬های ژنتیکی مقدار متوسط و کل وزن تولد بره¬های هر میش، مقدار متوسط و کل وزن شیرگیری بره¬های هر میش و اوزان 12 و24 ماهگی از تعداد 3542 رکورد مربوط به سال¬های 1384 الی 1389 گله¬های تحت پوشش مرکز تحقیقات استان قم جمع آوری شده بود، استفاده گردید. برآورد اجزاء واریانس با روش حداکثر درستنمایی محدود شده بی نیاز از مشتق¬گیری و با استفاده از مدل دام توسط م...

برآورد وراثت‌پذیری و پاسخ به انتخاب برای صفت تعداد میوه در جمعیت اصلاحی خیار

تعداد میوه در بوته اصلی‌ترین صفت تعیین کننده پتانسیل عملکرد لاین‌های خیار است. در این تحقیق بذرهای نسل F1 حاصل از تلاقی لاین‌های 118 و 119 خودگشن شده و نسل F2 به دست آمد. سپس هر یک از تک بوته‌ها، خودگشن شده و نتاج F3 به دست آمد. تعداد 10 بوته از هر کدام از جمعیت‌های F3خیار در خطوط جداگانه در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی کشت و صفات مرتبط با عملکرد جمعیت‌های F3 اندازه‌گیری و ثبت شد. سپس بذور جمع...

full text

برآورد پارامترهای ژنتیکی و تعیین روندهای فنوتیپی و ژنتیکی صفات رشد در یک گله گوسفند زندی

به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی و ارزیابی روند فنوتیپی و ژنتیکی صفات تولیدی رشد در یک گله گوسفند نژاد زندی موجود در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد خجیر که طی 16 سال (از سال 1371 الی 1386) رکورد برداری شده بودند ، طرح حاضر به انجام رسید. صفات مورد مطالعه شامل وزن تولد (5711 رکورد) ، وزن شیرگیری(4619 رکورد)، وزن 6 ماهگی (2801 رکورد) ، وزن 9 ماهگی (2124 رکورد) و وزن 12 ماهگی (2113 رکورد) بودند. مولف...

برآورد روندهای فنوتیپی و ژنتیکی برای صفت طول دوره خشکی سه دوره اول شیردهی گاوهای هلشتاین ایران

مطالعه حاضر به منظور برآورد فراسنجه‌های ژنتیکی و همچنین روند فنوتیپی و ژنتیکی صفت طول دورۀ خشکی در سه شکم زایش اول 162165 گاو هلشتاین ایران طی سال‌های 1364 تا 1385 انجام شد. در این تحقیق از 264297 رکورد زایش در 1114 گلۀ گاو هلشتاین با استفاده از مدل‌های خطی حیوانی تک‌صفته و دوصفته برای تجزیه ژنتیکی استفاده شد. روند ژنتیکی توسط تابعیت میانگین ارزش‌های اصلاحی به سال زایش محاسبه شد. میانگین طول دو...

full text

تاثیر وراثت پذیری و تعداد جایگاه صفات کمی بر میزان صحت برآورد ارزش اصلاحی ژنومی

در مقایسه با روش های اصلاح سنتی، استفاده از اطلاعات ژنومی باعث افزایش قابل ملاحظه ای در پاسخ به انتخاب برای حیوانات جوان فاقد رکورد فنوتیپی می شود. انتخاب ژنومیک بر انتخاب بر پایه ارزش اصلاحی برآورد شده ژنومی استوار است. هدف پژوهش حاضر بررسی تاثیر وراثت پذیری صفت و تعداد جایگاه صفات کمی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی بوده است. به این منظور طراحی ژنوم و جمعیت مورد نیاز از طریق شبیه سازی رای...

full text

صحت روش‌های مختلف بیزی در ارزیابی ژنومی صفات آستانه‌ای با معماری ژنتیکی متفاوت

چکیده سابقه و هدف: انتخاب ژنومی که نوعی انتخاب به کمک نشانگرهای ژنتیکی می‌باشد، اثر همه نشانگرهای ژنتیکی پراکنده در سرتاسر ژنوم را به‌طور هم‌زمان برآورد می‌کند. درنتیجه انتخاب ژنومی به‌طور بالقوه توانایی توجیه همه واریانس ژنتیکی صفت را دارد. اساس کار در انتخاب ژنومی عدم تعادل پیوستگی بین نشانگر و جایگاه صفات کمی می‌باشد. با توجه به کمتر مورد توجه قرار گرفتن ارزیابی ژنومی صفات دارای توزیع فنوتیپ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 7  issue 14

pages  179- 173

publication date 2016-12

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023